Kim2020.10.13 回答

生物資訊學中kog資料庫是什麼意思

根據需要從一級資料庫中搜集物件的相關資料集合而成的就是二級資料庫。

像genebank，EMBL這種都是不加選擇的一級資料庫，只要是實驗獲得的，不管什麼東西的序列，哪怕是不完整的序列都能上傳，而且它們的資料也有可能有重複。如果有某個人專門研究細菌的鑑定，需要用到正式被認可的16srDNA序列，為了研究方便，把這些一級資料庫的各個種類細菌的公認標準16srDNA序列的資料進行整理，重新構建了一個數據庫，這就是所謂的二級資料庫。如果不構建，直接用一級資料庫做blast，就會得出很多未被承認甚至不完整的序列，還要人工一個個看過去，找出公認的標準序列，這樣就很麻煩。我舉得例子在現實中就是韓國的EzTaxon。

鐵齒銅牙2017.06.08 回答

根據需要從一級資料庫中搜集物件的相關資料集合而成的就是二級資料庫。

像genebank，embl這種都是不加選擇的一級資料庫，只要是實驗獲得的，不管什麼東西的序列，哪怕是不完整的序列都能上傳，而且它們的資料也有可能有重複。如果有某個人專門研究細菌的鑑定，需要用到正式被認可的16srdna序列，為了研究方便，把這些一級資料庫的各個種類細菌的公認標準16srdna序列的資料進行整理，重新構建了一個數據庫，這就是所謂的二級資料庫。如果不構建，直接用一級資料庫做blast，就會得出很多未被承認甚至不完整的序列，還要人工一個個看過去，找出公認的標準序列，這樣就很麻煩。我舉得例子在現實中就是韓國的eztaxon。